Fakultas UIN Sunan Kalijaga

1. Adab dan Ilmu Budaya
2. Dakwah dan Komunikasi
3. Ilmu Tarbiyah dan Kegururuan
4. Syari'ah dan Hukum
5. Ushuluddin dan Pemikiran Islam
6. Sains dan Teknologi
7. Ilmu Sosial dan Humaniora
8. Ekonomi dan Bisnis Islam
9. Pascasarjana